1996年9月，《中国口腔种植学杂志》创刊，刊期为半年刊。

1997年，该刊刊期由半年刊变更为季刊。

2000年起，该刊由中华人民共和国卫生部口腔种植科技中心主办，期刊尺寸为29厘米。

2014年12月，该刊成为中国原国家新闻出版广电总局第一批认定学术期刊。

2018年起，该刊由中华口腔医学会主办，期刊内页有英文目次及文摘，版权页汉英对照。

2020年9月，中华口腔医学会按照规范的选举程序为《中国口腔种植学杂志》编委会组织了换届改选。

2021年，该刊刊期由季刊变更为双月刊。